学院拥有水利机械二级学科博士点。机械工程一级学科硕士点、材料加工工程二级学科学术型硕士点,具有机械工程、工业设计工程两个领域的专业硕士学位授予权。设有机械工程、能源与动力工程、金属材料工程、工业设计四个本科专业。机械工程在“十五”、“十一五”和“十二五”期间均被列为校级重点学科。2011年机械工程专业入选首批教育部“卓越工程师”培养计划。机械电子工程为水利部重点学科。
学院以机械工程学科为引领,坚持“入主流,有特色”这一发展思路,立足机械工程传统学科方向与国内外学科发展前沿,紧密围绕国家与地区社会经济发展及水利行业的重大需求,综合基础理论研究、工程应用与服务社会发展,形成如下学科研究方向:现代机械设计及理论、疏浚装备与疏浚技术、机电控制与机器人技术、水工金属结构设计与制造、热能工程及太阳能热利用、太阳能光伏利用技术、焊接自动化、机器人化和智能化技术、先进焊接和表面改性技术、人机系统及人机交互设计、产品设计及可用性评价等。